专家点评｜多团队合作开发mA定量测序方法

以往认为中心法则中DNA主要发挥模板的作用而信使RNA(mRNA)则扮演着信息传递者的角色。mRNA表观修饰的发现拓展了mRNA的功能。在RNA水平上的转录后修饰可通过顺式或者反式机理调控基因表达，测序方法对细胞功能、细胞命运决定至关重要。

尽管科学家们长时间以来了解RNA上存在转录后修饰，而这些修饰直到近年来才被认为从另一层面增加了基因表达调控的复杂性【1,2】。迄今为止，RNA上共发现有多于150种化学修饰【3】，包括m6A、m1A、pseudouridine、m5C等(图1)。这些修饰在“表观转录组”这一新颖且关键的层面调控基因的表达【4,5】。

m6A是mRNA内部含量最多，也是迄今研究最广泛的修饰【6】。m6A修饰最早发现于1974年，是哺乳动物mRNA内部最主要的修饰形式【1】，早期的研究工作表明m6A通常出现在(G/A)(m6A)C经典序列中【7,8】，其效应蛋白包括加上m6A修饰的“书写者”，擦掉m6A修饰的“擦除者”，以及识别m6A修饰的“识别者”(图1)。RNA 甲基化转移酶METTL3/14形成稳定的核心复合体作为“书写者”将mRNA上加上N6甲基化修饰【9,10】。

去甲基化酶FTO【11】和ALKBH5【12】则作为“擦除者”将该修饰去除。“书写者”和“擦除者”动态调控了RNA m6A的修饰水平。m6A的识别蛋白含有YTH结构域，包括YTHDF1-3 , YTHDC1-2【13-17】，这些“识别者”识别RNA的m6A修饰并招募该RNA到特殊的蛋白复合体中，从而通过影响mRNA的代谢过程如剪接、出核、降解和翻译等调控基因表达，在发育，生理和病理过程中扮演重要角色